La cripta dello Spirito Santo, una vera e propria chiesa ipogeica, è situata a Sud-Ovest della città, nei pressi del Cimitero.

All’interno è divisa in tre navate, scandite da colonne e archi a tutto sesto e chiuse da altrettante absidi.

I suoi pilastri, dotati ciascuno di un capitello differente, a motivi vegetali ed umani, articolano uno pseudo soffitto a crociera e conferiscono alla cripta un aspetto "a Basilica".

Purtroppo, anche a causa della scomparsa delle decorazioni parietali, oggi è difficile individuare la sua origine (forse risalente al secolo XII o XIII) e la sua funzione.
Tuttora, una settimana dopo Pasqua, ogni giovedì, per 7 settimane, un gruppo di fedeli percorre a piedi il tratto che va dal Cimitero alla cripta, recitando rosari e preghiere in segno di voto.

Fonte: Francesco Pepe, Monopoli città unica Guida Turistica e Culturale, Zaccaria Edizioni, Monopoli 1996